Wzmacniacze:Są to sekwencje DNA, które wiążą czynniki transkrypcyjne i promują transkrypcję pobliskich genów. Na przykład wzmacniacz w locus łańcucha ciężkiego immunoglobuliny jest odpowiedzialny za wysoki poziom ekspresji tych genów w limfocytach B.
Promotory:Są to sekwencje DNA, które wiążą polimerazę RNA i inicjują transkrypcję genów. Na przykład promotor w genie ludzkiego hormonu wzrostu jest odpowiedzialny za ekspresję tego genu w przysadce mózgowej.
Tłumiki:Są to sekwencje DNA, które wiążą czynniki transkrypcyjne i tłumią transkrypcję pobliskich genów. Na przykład tłumik w genie ludzkiej β-globiny jest odpowiedzialny za represję tego genu w komórkach nieerytroidalnych.
Sekwencje działające w trybie trans:
Czynniki transkrypcyjne:Są to białka, które wiążą się z sekwencjami działającymi w układzie cis i regulują transkrypcję genów. Na przykład czynnik transkrypcyjny Oct-1 wiąże się z motywem oktameru we wzmacniaczu ciężkiego łańcucha immunoglobuliny i promuje transkrypcję tych genów w limfocytach B.
Polimeraza RNA:Jest to kompleks białkowy, który wiąże się z promotorami i dokonuje transkrypcji genów na RNA.
Inne białka regulatorowe:Są to białka, które wiążą się z sekwencjami działającymi w układzie cis i regulują transkrypcję genów na różne sposoby. Na przykład białko CTCF wiąże się z motywem CCCTC w genie ludzkiej β-globiny i pomaga uporządkować strukturę chromatyny tego regionu, co jest niezbędne do represji genu w komórkach nieerytroidalnych.