Jednakże najbardziej znanym i głównym antagonistą jest Loki , przybrany brat Thora i główna przyczyna konfliktu w filmie. Organizuje inwazję na Ziemię, chcąc podbić planetę i rządzić nią.
Podczas gdy inni antagoniści, tacy jak Chitauri (armia obcych) i agenci HYDRY odgrywają znaczącą rolę w filmie, Loki pozostaje siłą napędową i głównym antagonistą, który bezpośrednio konfrontuje się z Avengersami.