„Morderstwo w Orient Expressie” porusza temat tożsamości i jej złożoności. Powieść przedstawia kilka postaci o różnym pochodzeniu, kulturze i celach, z których każda kryje ukrytą tożsamość lub skrywa sekrety. Detektyw Poirot musi spojrzeć poza powierzchnię, aby poznać prawdziwe charaktery i motywacje pasażerów.
Istotną rolę w tej historii odgrywa także wątek sprawiedliwości. Poirot pragnie nie tylko rozwiązać sprawę, ale także zapewnić, że sprawiedliwości stanie się zadość. Pasażerowie stają przed dylematem etycznym, gdy wspólnie decydują o losie mordercy. Muszą zdecydować, czy postępować zgodnie ze ścisłymi procedurami prawnymi, czy też wziąć sprawy w swoje ręce, aby osiągnąć poczucie sprawiedliwości, które ich zdaniem jest konieczne.
Powieść stawia intrygujące pytania o złożoność ludzkiej tożsamości, niejednoznaczność moralności oraz poszukiwanie prawdy i sprawiedliwości.