Chalcedon jest najpowszechniejszą formą kwarcu kryptokrystalicznego. Termin „kryptokrystaliczny” oznacza, że kryształy tworzące minerał są tak małe, że nie można ich rozpoznać gołym okiem ani pod zwykłym mikroskopem. Występujący w postaci kryptokrystalicznego agregatu w postaci włóknistej, staje się kamieniem szlachetnym znanym jako chryzopraz.
Terminu chalcedon używa się w dwóch konkretnych przypadkach:po pierwsze, dla określonego typu struktury mikrokrystalicznej charakteryzującej się naprzemiennymi warstwami włóknistymi kwarcu kryptokrystalicznego; po drugie, szerzej, aby opisać szereg kamieni szlachetnych pasujących do tego opisu, w tym odmiany półprzezroczyste, takie jak agat, karneol, chryzopraz, jaspis i onyks, a także niektóre okazy nieprzezroczyste.