Sala tortur znajdowała się w podziemiach wieży i składała się z szeregu małych, ciemnych cel. Każda cela była wyposażona w różnorodne narzędzia tortur, w tym stojaki, bicze i śruby kciukowe. Więźniowie często byli rozbierani do naga i poddawani wielogodzinnym torturom w celu wyciągnięcia zeznań lub informacji na temat swoich przekonań religijnych.
Niektóre z najczęstszych metod tortur stosowanych w Torre de la Inquisición obejmowały:
- Stojak: Więźnia przywiązano do drewnianej ramy i rozciągano, aż do zwichnięcia stawów.
- Bicz: Więźnia chłostano biczem wykonanym ze skóry lub metalowych prętów.
- Śruby skrzydełkowe: Kciuki więźnia zostały zmiażdżone dwiema metalowymi śrubami.
- Leczenie wodne: Więzień był zmuszany do picia dużych ilości wody, aż do wymiotów lub utonięcia.
- Pożar: Więźnia palono rozżarzonymi węglami lub pochodniami.
Torre de la Inquisición była brutalnym i przerażającym miejscem, a wielu torturowanych tam więźniów zmarło z powodu odniesionych obrażeń. Izba tortur została ostatecznie zamknięta w XVIII wieku, ale pozostaje mrożącym krew w żyłach przypomnieniem mrocznej historii hiszpańskiej inkwizycji.