* CGI: Większość środowisk 3D, postaci i efektów specjalnych została utworzona przy użyciu kombinacji oprogramowania. Do najbardziej znanych należą:
* Maja: Powszechnie uważana za branżowy standard animacji i modelowania 3D, Maya prawdopodobnie odegrała znaczącą rolę w tworzeniu skomplikowanych środowisk i postaci w filmie.
* Obraz programowy: Wykorzystano kolejne potężne oprogramowanie do animacji 3D, Softimage, ze względu na jego niezawodne narzędzia do animacji postaci i możliwości konfiguracji.
* ZBrush: Znany ze swoich możliwości cyfrowego rzeźbienia, ZBrush był prawdopodobnie używany do rzeźbienia i opracowywania szczegółów modeli postaci w wysokiej rozdzielczości.
* Tradycyjna animacja: Film łączył także elementy tradycyjnej animacji, szczególnie w sekwencjach, w których pożądany był bardziej wyrazisty i ręcznie rysowany styl. Prawdopodobnie dotyczyło to oprogramowania takiego jak:
* Harmonia Toon Boom: Popularne oprogramowanie do animacji 2D, które pozwala na połączenie technik animacji tradycyjnej i cyfrowej.
Warto pamiętać, że: Konkretne oprogramowanie użyte w „Alicji w Krainie Czarów” nie jest szczegółowo opisane w napisach końcowych. Informacje te są powszechnie uważane za zastrzeżone dla studia i twórców filmu.
Biorąc jednak pod uwagę popularność i możliwości oprogramowania w branży efektów wizualnych, rozsądne jest założenie, że wspomniane narzędzia odegrały znaczącą rolę w ożywieniu fantastycznego świata filmu.