W całej piosence Vedder zastanawia się nad swoją relacją z matką, wyrażając poczucie winy i żalu. Rozważa pomysł „trzymania się” jej pamięci i wpływu, jaki jej śmierć wywarła na jego życie. Teksty poruszają także tematy odkupienia i poszukiwania duchowego przewodnictwa w chwilach smutku.
Piosenka jest także refleksją na temat złożonych emocji związanych ze stratą rodzica, w tym złości, smutku i tęsknoty za przeszłością. Chór podkreśla ideę przebaczenia i odnalezienia spokoju, jak śpiewa Vedder:„Jestem szczęściarzem, że mogę policzyć na obu rękach tych, których kocham”.
„Daughter” to głęboko osobista i przejmująca piosenka, która przemawia do powszechnego doświadczenia straty i żalu. Przypomina o głębokim wpływie, jaki śmierć bliskiej osoby może mieć na nasze życie, i zachęca nas do szukania pocieszenia we wspomnieniach, które są nam bliskie.