Tekst piosenki nawiązuje do obrazów związanych z nauką i eksperymentami. Bohater utworu jest przedstawiany jako „naukowiec”, który przeprowadza eksperymenty i obserwacje, próbując zrozumieć otaczający go świat. Zastanawiają się nad pytaniami o naturę istnienia, pochodzenie życia i cel wszechświata.
W całym utworze Coldplay podkreśla znaczenie wytrwałości i odporności w dążeniu do wiedzy. Teksty sugerują, że nawet w obliczu niepowodzeń i niepowodzeń ważne jest, aby kontynuować poszukiwanie odpowiedzi i nigdy nie tracić z oczu celu, jakim jest zrozumienie wszechświata.
„Naukowiec” wyraża także zachwyt i podziw dla piękna i złożoności świata przyrody. Bohater zachwyca się ogromem wszechświata, zawiłymi szczegółami życia i tajemnicami, które pozostają nierozwiązane. Piosenka zachęca słuchaczy do doceniania cudów świata i szukania inspiracji w dążeniu do wiedzy naukowej.
W istocie „Scientist” Coldplay celebruje ludzkie pragnienie zrozumienia i zachęca nas do odkrywania świata z ciekawością i zachwytem. Przypomina o znaczeniu nauki i dążenia do wiedzy w kształtowaniu naszego rozumienia wszechświata i naszego w nim miejsca.