Oto, co wiemy o jego twórczości muzycznej:
* Był przede wszystkim muzykiem kościelnym. Prawdopodobnie dlatego większość jego kompozycji przeznaczona była do nabożeństw, takich jak kantaty, motety i dzieła organowe.
* Przypuszcza się, że napisał kilka kantat i chorałów. Niestety, żaden z nich nie zachował się.
* Napisał także kilka utworów na klawisze. Niektóre z nich nadal istnieją, na przykład „Allein Gott in der Höh sei Ehr” i „Christ lag in Todesbanden”, które są uważane za wczesne przykłady barokowej muzyki organowej.
Trzeba pamiętać, że nasza wiedza na temat twórczości Johanna Christopha Bacha jest bardzo ograniczona ze względu na brak zachowanych rękopisów. Nie da się zatem podać pełnej listy jego kompozycji.
Jednak zachowane dzieła oferują cenny wgląd w środowisko muzyczne, w którym dorastał Jan Sebastian Bach i pozostawał pod jego wpływem.