W Shrek Trzeci Shrek i Fiona wkrótce zostaną rodzicami. Zanim jednak zdążą się uspokoić, przerywa im posłaniec z Far Far Away. Posłaniec informuje ich, że król Harold zmarł, a Shrek jest następny w kolejce do tronu.
Shrek niechętnie przyjmuje rolę króla, ale ostatecznie się zgadza. On, Fiona i Osioł wyruszają do Far Far Away, gdzie spotykają się z wrogością ze strony obywateli. Spotykają także księcia z bajki, który jest zdeterminowany, by przejąć królestwo dla siebie.
Z pomocą przyjaciół Shrek jest w stanie pokonać księcia z bajki i ocalić królestwo. Dowiaduje się także, że jest dobrym ojcem i że stać go na dobrego króla.
Oprócz głównego wątku fabularnego Shrek the Third zawiera także szereg wątków pobocznych. Te wątki poboczne obejmują przygody Osła i Kota w Butach, a także próby Złej Czarownicy mające na celu ożywienie jej męża, Lorda Farquada.
Shrek Trzeci to zabawny i wciągający film, który z pewnością zadowoli fanów serii Shrek. To opowieść o rodzinie, przyjaźni i tym, jak ważne jest bycie wiernym sobie.