1. Super Junior-K.R.Y.:Pododdział ten składa się z trzech członków – Kyuhyuna, Ryeowooka i Yesunga. Są znani ze swoich uduchowionych ballad i potężnego wokalu.
2. Super Junior-T:Ta podgrupa promuje się w Tajlandii i składa się z członków Leeteuk, Heechul, Shindong, Sungmin i Eunhyuk. Wykonują piosenki w języku tajskim i koreańskim.
3. Super Junior-M:Podjednostka ta działa głównie w Chinach i składa się z członków Hangeng (były członek), Siwon, Donghae, Ryeowook, Kyuhyun i Zhou Mi. Wykonują piosenki w języku chińskim mandaryńskim.
4. Super Junior-H:Podjednostka ta znana jest z muzyki kłusa. W jego skład wchodzą członkowie Leeteuk, Yesung, Kangin, Shindong, Sungmin i Eunhyuk. Kłus to tradycyjny koreański gatunek muzyczny charakteryzujący się szybkim tempem i optymistycznymi rytmami.
5. Super Junior-D&E:Ten duet składa się z członków Donghae i Eunhyuka. Są znani z chwytliwej elektronicznej muzyki tanecznej i energicznych występów.
6. Super Junior-Happy:Podjednostka ta charakteryzuje się jasną i wesołą muzyką. Składa się z członków Yesung, Shindong, Sungmin i Leeteuk.
Te podgrupy pozwalają Super Juniorowi odkrywać różne style i koncepcje muzyczne, jednocześnie prezentując talenty i mocne strony różnych członków.