Akt wyeliminowania klanu Uchiha przez Itachiego nie był jedynie bezmyślną masakrą, ale złożoną decyzją wynikającą z kilku motywów i okoliczności:
Zapobieganie wojnie domowej:Klan Uchiha żywił urazę do przywódców wioski Konoha i planował zamach stanu w celu obalenia Trzeciego Hokage. Itachi, jako podwójny agent, wziął na siebie obowiązek zapobieżenia zdradzieckim działaniom klanu, które pogrążyły wioskę w chaosie i rozlewie krwi.
Ochrona Konohy:Lojalność Itachiego wobec Konohy była nieustępliwa. Przedkładał bezpieczeństwo całej wioski, w tym niewinnych cywilów, nad aspiracje do władzy własnego klanu. Niszcząc klan Uchiha, zapobiegł potencjalnemu konfliktowi, który zakończyłby się zniszczeniem Konohy.
Wpływ Danzo:Itachi był pod wpływem i manipulowany przez Danzo Shimurę, wysokiego rangą urzędnika Konohy, który nakazał mu eksterminację klanu Uchiha pod pozorem ochrony wioski. Działania Itachiego wynikały z jego zaangażowania w ochronę wioski i niezachwianej uległości wobec autorytetów.
Sparting Sasuke:Pomimo eksterminacji swojego klanu, Itachi oszczędził swojego młodszego brata Sasuke. Miłość Itachiego do brata zmotywowała go do oszczędzenia życia Sasuke, nawet za cenę zostania najbardziej poszukiwanym przestępcą w wiosce i przetrwania nienawiści Sasuke. Itachi miał nadzieję, że jego śmierć z rąk Sasuke zapewni jego bratu motywację i siłę, by stać się silniejszym.
Trauma emocjonalna:Akt zabicia jego klanu i wynikająca z tego izolacja, z jaką się spotkał, pozostawiły głęboką emocjonalną bliznę na psychice Itachiego. Do końca życia dźwigał winę i ból swoich czynów.
Decyzja Itachiego była wynikiem skomplikowanych okoliczności, podzielonej lojalności i ogromnego poświęcenia. Był to ponury, konieczny wybór, którego celem było zachowanie pokoju w Konoha, ochrona jego brata i zapewnienie, że przyszłość wioski pozostanie bezpieczna, nawet kosztem jego reputacji i dobrego samopoczucia.