Istnieją dowody sugerujące, że cesarskie cięcie mogło być wykonywane w czasach starożytnych. Na przykład starożytny grecki lekarz Hipokrates opisał zabieg zwany „embriotomią”, który polegał na rozcięciu macicy w celu usunięcia dziecka. Nie jest jednak jasne, czy kiedykolwiek faktycznie przeprowadzono embriotomię i możliwe jest, że Hipokrates po prostu spekulował.
Pierwszy udokumentowany przypadek udanego cięcia cesarskiego wykonał w 1500 roku szwajcarski lekarz Jacob Nufer. Pacjentką Nufera była kobieta o imieniu Elisabeth Strüb, która cierpiała na schorzenie zwane pęknięciem macicy. Nuferowi udało się usunąć dziecko z macicy Strüba i zarówno matka, jak i dziecko przeżyły.
W ciągu wieków, które upłynęły od czasów Nufera, cesarskie cięcie stało się coraz bardziej powszechne. Obecnie cesarskie cięcie wykonuje się w przypadku około 30% wszystkich porodów w Stanach Zjednoczonych.