Urodził się w Davao City, Davao na Filipinach i był żonaty z Mercedes Cacho. Był ojcem byłej burmistrz miasta Davao, Sary Duterte, córki wiceprezydenta Inday Sary Duterte-Carpio i byłego kongresmana z 3. dystryktu Davao Paolo „Pulonga” Duterte.
Alvarez, weteran polityki w mieście Davao, po raz pierwszy zajął się polityką w 1965 r., kiedy został wybrany wiceburmistrzem miasta. Jego dwukadencja burmistrza charakteryzowała się kampanią przeciwko muzułmańskim rebeliantom na tym obszarze oraz agresywnym programem rozwoju gospodarczego. Popierał także prezydenturę Ferdynanda Marcosa.
W czasie stanu wojennego Alvarez został wybrany na przedstawiciela 3. okręgu Davao w 1978 r. Został wybrany ponownie w 1980 i 1984 r. Był integralną częścią machiny Marcosa i sojusznikiem zmarłego prezydenta.
Kiedy Marcos został obalony podczas rewolucji władzy ludowej w 1986 r., Alvarez zmienił stronę i dołączył do rządu prezydenta Corazona Aquino. Następnie został mianowany sekretarzem obrony narodowej.
W 1987 roku został mianowany administratorem filipińskiego urzędu ds. orzechów kokosowych. Funkcję pełnił do 1990 r.