Gra nie oferuje żadnej możliwości zdobycia tego upragnionego przedmiotu. Jest to wspólna cecha serii Pokemon, gdzie Master Ball to rzadki i potężny przedmiot, który zwykle jest dawany na początku gry lub zdobywany w wyniku określonych wydarzeń.
Należy zauważyć, że chociaż w Pokemon XD nie można zdobyć Master Balla, nadal istnieje kilka bardzo skutecznych sposobów łapania Pokemonów, w tym używanie innych typów Poke Balli i stosowanie strategii takich jak osłabianie Pokemona przed próbą jego złapania.