* Wydruk: Niektóre karty zostały wydrukowane w bardzo ograniczonych ilościach, np. karty promocyjne lub rozdawane podczas określonych wydarzeń.
* Stan: Stan karty w dużym stopniu wpływa na jej rzadkość. Karta w nieskazitelnym stanie będzie znacznie rzadsza niż karta intensywnie używana lub uszkodzona.
* Wydanie: Różne wydruki tej samej karty mogą mieć różną rzadkość, przy czym wczesne wydania są często bardziej poszukiwane.
* Zapotrzebowanie: Popularność karty i zainteresowanie kolekcjonerów mogą również wpływać na jej postrzeganą rzadkość.
Oto jednak kilka kart, które często są uważane za jedne z najrzadszych:
* Zestaw „Legendarna Exodia”: Ten zestaw pięciu kart jest niezwykle rzadki, zwłaszcza karta „Exodia Zakazana”, ponieważ była dostępna tylko w zestawie „Legenda o niebieskookim białym smoku”.
* Karty „Super Secret Rare” (SSR): Karty te były początkowo drukowane w ograniczonych ilościach i cieszą się dużym zainteresowaniem, zwłaszcza ze starszych zestawów.
* Karty „Gold Secret Rare” (GSR): Karty te zostały wprowadzone w zestawie „Siła Maga” i są niezwykle rzadkie ze względu na ograniczony nakład.
* Karty „Rzadkie duchy”: Karty te zostały pierwotnie wprowadzone w zestawie „Duelist of the Roses” i mają unikalny efekt holograficzny. Są bardzo kolekcjonerskie i rzadkie.
* Karty „Edycji limitowanej” (LE): Karty te zostały wydrukowane w ograniczonych ilościach i często są rozdawane podczas specjalnych wydarzeń lub turniejów.
Ostatecznie najrzadsza karta Yugioh to ta, którą najtrudniej znaleźć w dobrym stanie i która jest bardzo poszukiwana przez kolekcjonerów.