* Osobiste urazy: Putnam miał historię nieporozumień z wieloma osobami, które oskarżył o czary. Na przykład toczył spór z Georgem Jacobsem o kawałek ziemi, a także bezskutecznie pozwał Martę Corey za pomówienie.
* Przekonania religijne: Putnam był pobożnym purytaninem i wierzył, że czary stanowią realne zagrożenie dla społeczności. Wierzył, że czarownice są w zmowie z diabłem i że są w stanie wyrządzić krzywdę innym.
* Zyski finansowe: Motywacją Putnama mogły być również korzyści finansowe. Mógł odebrać majątek osób skazanych za czary, a także otrzymać rekompensatę za czas poświęcony na prowadzenie śledztw w sprawach o czary.
Warto zauważyć, że nie wszystkie osoby oskarżone o czary przez Thomasa Putnama były winne. W rzeczywistości wielu z nich to niewinni ludzie, którzy byli celem po prostu dlatego, że mieli osobistą skargę do Putnama lub dlatego, że byli członkami marginalizowanej grupy.