W Super Mario Flash 2 wskakujesz, naciskając klawisz strzałki w górę (↑) .
Podobnie jak w klasycznych grach Super Mario, możesz także przytrzymać klawisz skoku, aby skoczyć wyżej i naciśnij skok w powietrzu, aby wykonać podwójny skok jeśli masz doładowanie.