Groudon (typ naziemny)
* Znaleziony w Jaskini Pochodzenia po pokonaniu Elitarnej Czwórki i zostaniu Czempionem.
* Można go złapać dopiero po zdobyciu Czerwonej Kuli.
Kyogre (typ wodny)
* Znaleziony w Jaskini Pochodzenia po pokonaniu Elitarnej Czwórki i zostaniu Czempionem.
* Można go zdobyć dopiero po zdobyciu Niebieskiej Kuli.
Rayquaza (typ smoka/latający)
* Można go znaleźć w Niebiańskim Filaru po pokonaniu Groudona i Kyogre'a.
* Można go zdobyć dopiero po zdobyciu Czerwonej Kuli i Niebieskiej Kuli.
Regirock (typ skały)
* Znaleziony w starożytnej świątyni na pustyni, dostępny po zdobyciu trzech kluczy Regi.
* Musisz aktywować świątynię za pomocą klawiszy w określonej kolejności.
Regice (typ lodowy)
* Znaleziony w starożytnej świątyni na pustyni, dostępny po zdobyciu trzech kluczy Regi.
* Musisz aktywować świątynię za pomocą klawiszy w określonej kolejności.
Registeel (typ stalowy)
* Znaleziony w starożytnej świątyni na pustyni, dostępny po zdobyciu trzech kluczy Regi.
* Musisz aktywować świątynię za pomocą klawiszy w określonej kolejności.
Latias (typ smoka/psychiczny)
* Znaleziony na Wyspie Południowej po zdobyciu Fletu Eonowego.
* Dostępne tylko po zdobyciu Eonowego Fletu.
Latios (typ smoka/psychiczny)
* Znaleziony na Wyspie Południowej po zdobyciu Fletu Eonowego.
* Dostępne tylko po zdobyciu Eonowego Fletu.
Jirachi (typ stalowy/psychiczny)
* Można go znaleźć w Domu Życzeń po zdobyciu Gwiezdnego Kamienia.
* Jest to rzadkie spotkanie i będziesz musiał użyć Gwiezdnego Kamienia, aby je obudzić.
Miau (typ psychiczny)
* Technicznie niemożliwe do zdobycia w trakcie normalnej rozgrywki. Aby zdobyć, wymagane jest urządzenie z usterką lub oszustwem.
Uwaga: Chociaż technicznie rzecz biorąc, możesz uzyskać Mewtwo w Pokémon Emerald nie jest to spotkanie Legendarne. Można go znaleźć w opuszczonej rezydencji Pokémon w obszarze miasta Slateport.