* 1567: Po śmierci męża, lorda Darnleya, i małżeństwie z hrabią Bothwell, Maria została zmuszona do abdykacji ze szkockiego tronu i uwięziona w zamku Lochleven .
* 1568: Uciekła z zamku Lochleven, ale została pokonana w bitwie pod Langside i uciekła do Anglii, gdzie była więziona do końca życia. Początkowo była przetrzymywana w zamku Carlisle.
* 1568-1572: Została przeniesiona do zamku Bolton, a następnie do zamku Sheffield.
* 1572-1587: Mary została przeniesiona do zamku Tutbury, Wingfield Manor, Coventry, Chatsworth House i wreszcie do zamku Fotheringhay, gdzie została osądzona i stracona w 1587 roku.
Warto zauważyć, że nie zawsze była trzymana w trudnych warunkach. Niektóre z jej więzień były wygodniejsze niż inne, w zależności od lokalizacji i klimatu politycznego. Zawsze jednak znajdowała się pod ścisłą ochroną i nigdy nie odzyskała wolności.