W grze występuje 25 różnych Natur, każda z własnym pozytywnym i negatywnym wpływem na określone statystyki. Na przykład Pokémon z Odporną Naturą nie ma żadnych modyfikacji statystyk, podczas gdy Pokémon z Wesołą Naturą ma zwiększoną Szybkość i zmniejszenie Specjalnego Ataku.
Zrozumienie Natur i zarządzanie nimi jest kluczowe w budowaniu skutecznego zespołu Pokémon, ponieważ mogą one wpływać na ogólne mocne i słabe strony Pokémona. Gracze mogą spotykać i rekrutować Pokémony o określonej Naturze podczas eksploracji lochów lub korzystając z funkcji Wonder Mail, aby połączyć się z innymi graczami.