- Słabe umiejętności żeglarskie: Wczesne podróże Drake'a naznaczone były złymi umiejętnościami żeglarskimi i lekkomyślnymi decyzjami, które doprowadziły do straty kilku statków i członków załogi.
- Brak doświadczenia: Drake miał niewielkie doświadczenie w dowodzeniu dużą flotą statków, a jego załogi często były niedoświadczone i niezdyscyplinowane.
- Zła pogoda: Podróże Drake'a często nękały zła pogoda, w tym burze i mgła, które sprawiały, że nawigacja i żeglowanie były niebezpieczne.
- Choroba: Choroby były ciągłym zagrożeniem dla załóg Drake'a, a wielu marynarzy zmarło na szkorbut, czerwonkę i inne choroby.
- Wrodzy tubylcy: Drake napotkał wrogie plemiona tubylcze w wielu częściach świata i często był zmuszony walczyć w obronie swoich statków i załóg.
- Hiszpańskie okręty wojenne: Hiszpanie byli głównym wrogiem Drake'a i wysłali kilka okrętów wojennych, aby go wytropić i zniszczyć jego flotę.