Jedna z teorii głosi, że bałałajka została wynaleziona przez samych Rosjan. Wynika to z faktu, że bałałajka jest tradycyjnym instrumentem rosyjskim, a istnieją dowody na jej istnienie w Rosji już w XVII wieku.
Inna teoria głosi, że bałałajka została wynaleziona przez grupę rosyjskich muzyków zwanych guslarami. Guslarowie byli wędrownymi muzykami grającymi na różnych instrumentach smyczkowych, w tym na bałałajce. Uważa się, że rozpowszechnili wiedzę o bałałajce w całej Rosji.
Wreszcie niektórzy uważają, że bałałajkę mógł wynaleźć niejaki Wasilij Andriejew. Andriejew był rosyjskim muzykiem i kompozytorem żyjącym na przełomie XIX i XX wieku. Przypisuje się mu spopularyzowanie bałałajki i zwrócenie na nią uwagi świata.
Ostatecznie prawdziwy wynalazca bałałajki może nigdy nie zostać poznany. Instrument ten ma jednak długą i bogatą historię, a muzycy na całym świecie nadal grają na nim.