Do krytycznych wobec chrześcijaństwa utworów Slayera należą „Angel of Death”, „South of Heaven” i „Raining Blood”. Piosenki te zawierają teksty krytyczne wobec Kościoła katolickiego, Biblii i koncepcji Boga. Należy jednak pamiętać, że piosenek tych nie należy rozumieć dosłownie i że stanowią one po prostu formę artystycznej ekspresji.
Muzyka Slayera została skrytykowana przez niektóre grupy religijne, które uważają, że promuje przemoc i mowę nienawiści. Zespół jednak bronił swojej muzyki, twierdząc, że chroni ją Pierwsza Poprawka do Konstytucji Stanów Zjednoczonych.
Ogólnie rzecz biorąc, Slayer to kontrowersyjny zespół, krytykowany za antychrześcijańskie motywy. Jednak sami członkowie zespołu oświadczyli, że nie są antychrześcijańscy i że ich muzyki nie należy traktować poważnie.