- Symfonie :Haydn skomponował ponad 100 symfonii, a wiele z nich uważa się za arcydzieła okresu klasycznego. Do jego najsłynniejszych symfonii należą:
- Symfonia nr 45 „Pożegnanie”
- Symfonia nr 60 „Il distratto”
- Symfonia nr 88, „Litera V”
- Symfonia nr 92 „Oxford”
- Symfonia nr 94 „Niespodzianka”
- Symfonia nr 101 „Zegar”
- Symfonia nr 103 „Werble”
- Symfonia nr 104 „Londyn”
- Kwartety smyczkowe :Haydn skomponował także ponad 80 kwartetów smyczkowych, które są uważane za jedne z najwspanialszych przykładów tego gatunku. Do jego najsłynniejszych kwartetów smyczkowych należą:
- Kwartet smyczkowy G-dur op. 76, nr 1
- Kwartet smyczkowy C-dur op. 76, nr 3 („Cesarz”)
- Kwartet smyczkowy f-moll op. 20, nr 5
- Kwartet smyczkowy g-moll op. 74, nr 3 („Jeździec”)
- Kwartet smyczkowy d-moll op. 76, nr 2 („Quinten”)
- Kwartet smyczkowy B-dur op. 76, nr 4 („Wschód słońca”)
- Sonaty fortepianowe :Haydn skomponował ponad 50 sonat fortepianowych, które charakteryzują się elegancją i dowcipem. Do jego najsłynniejszych sonat fortepianowych należą:
- Sonata fortepianowa C-dur Hob. XVI:50
- Sonata fortepianowa D-dur Hob. XVI:24
- Sonata fortepianowa Es-dur Hob. XVI:49
- Sonata fortepianowa F-dur Hob. XVI:23
- Sonata fortepianowa G-dur Hob. XVI:40
- Koncerty :Haydn skomponował różnorodne koncerty na różne instrumenty, w tym koncerty skrzypcowe, koncerty wiolonczelowe i koncerty fortepianowe. Do jego najsłynniejszych koncertów należą:
- Koncert skrzypcowy G-dur Hob. VIIa:4
- Koncert wiolonczelowy C-dur Hob. VIIb:1
- Koncert fortepianowy D-dur Hob. XVIII:11
- Koncert fortepianowy B-dur Hob. XVIII:13
- Oratoria :Haydn skomponował także kilka oratoriów, które są wielkoformatowymi dziełami chóralnymi z tekstami religijnymi. Do jego najsłynniejszych oratoriów należą:
- Stworzenie
- Pory roku
- Il ritorno di Tobia