1. Próby zrekrutowania Tamino: Na początku opery pojawia się Królowa Nocy, prosząc o pomoc młodego księcia Tamina. Daje mu magiczny portret swojej córki Paminy i prosi o uratowanie jej ze szponów Sarastra, arcykapłana Świątyni Mądrości.
2. Przyznaje magiczne przedmioty: Królowa Nocy wyposaża Tamino w magiczny flet, a Papageno, łapacz ptaków, w magiczny dzwonek. Te magiczne instrumenty odgrywają kluczową rolę w pomaganiu obojgu w pokonywaniu przeszkód i oczarowywaniu tych, których spotykają na swojej drodze.
3. Spiski przeciwko Sarastro: Królowa Nocy żywi głęboką urazę do Sarastra, który według niej porwał Paminę i przetrzymuje ją wbrew jej woli. Próbuje manipulować i oszukiwać Tamino i Papageno, aby działać przeciwko Sarastro i jego zwolennikom.
4. Wyznacza próby dla Tamino: Tamino i Papageno przechodzą kilka prób i wyzwań postawionych przez Sarastro. Królowa Nocy próbuje interweniować i wpływać na te próby, używając swojej magii i przebiegłości, aby przeszkodzić w ich powodzeniu.
5. Konfrontacja z Sarastro: W kulminacyjnej scenie Królowa Nocy konfrontuje się z Sarastro w jego świątyni, oskarżając go o zdradę i żądając uwolnienia Paminy. Sarastro odkrywa prawdziwą naturę swoich zamiarów, które są raczej szlachetne i mądre niż złośliwe.
6. Porażka i wygnanie: Królowa Nocy zostaje ostatecznie pokonana przez Sarastro i jego siły. Została wygnana z królestwa światła, a jej moc została zmniejszona. Jej córka Pamina ponownie spotyka się z Tamino i wspólnie triumfują nad siłami ciemności.