Co to jest indeks Jacobsena?

Indeks Jacobsena drzewa filogenetycznego jest miarą jego rozgałęzienia, czyli stopnia, w jakim drzewo zawiera krótkie gałęzie wewnętrzne. Definiuje się ją jako stosunek całkowitej długości drzewa (suma długości wszystkich gałęzi w drzewie) do minimalnej możliwej długości drzewa, czyli długości drzewa z taką samą liczbą taksonów i bez gałęzi wewnętrznych ( wszystkie taksony są połączone bezpośrednio z korzeniem).

Wysoki indeks Jacobsena wskazuje na drzewo z wieloma krótkimi gałęziami wewnętrznymi, co może być wynikiem szybkiego napromieniania taksonów lub wysokiego tempa ewolucji charakteru. Niski wskaźnik Jacobsena wskazuje na drzewo z kilkoma krótkimi gałęziami wewnętrznymi, co może wynikać z powolnego napromieniania taksonów lub niskiego tempa ewolucji cech.

Indeks Jacobsena jest często używany do porównywania względnej rozgałęzienia różnych drzew filogenetycznych i może być stosowany do oceny dopasowania różnych modeli ewolucyjnych do danego zbioru danych.