Wyróżnienia naukowe:
* Medal Copleya (1874) :Przyznany przez Royal Society of London, jedną z najbardziej prestiżowych nagród naukowych na świecie, za prace nad fermentacją i teorią chorób zarazków.
* Medal Rumforda (1874) :Nagroda przyznana przez Royal Society of London za badania nad polaryzacją światła i jej zastosowaniami.
* Medal Alberta (1881) :Nagroda Królewskiego Towarzystwa Sztuki za wkład w zdrowie publiczne i zapobieganie chorobom.
* Kawaler Legii Honorowej (1853) :Prestiżowe francuskie wyróżnienie przyznawane osobom, które wniosły znaczące zasługi dla narodu.
* Wielki Krzyż Legii Honorowej (1881) :Najwyższy stopień Legii Honorowej, uznający wyjątkowe osiągnięcia Pasteura.
* Członek Francuskiej Akademii Nauk (1862) :Jedno z najwyższych wyróżnień naukowych we Francji.
* Zagraniczny członek Towarzystwa Królewskiego (1869) :Zaszczyt w uznaniu jego wkładu w naukę poza Wielką Brytanią.
Inne nagrody:
* Nagroda Francuskiej Akademii Nauk (1856) :Nagrodzony za pracę nad fermentacją.
* Nagroda Paryskiej Akademii Nauk (1862) :Nagrodzony za pracę nad zarazkową teorią chorób.
Oprócz tych konkretnych nagród Pasteur otrzymał w swojej karierze także wiele innych wyróżnień i wyróżnień, co ugruntowało jego dziedzictwo jako jednego z najbardziej wpływowych naukowców XIX wieku.