- 2007 MTV Europe Music Awards:Najlepszy Rock
- 2010 MTV Video Music Awards:Najlepszy teledysk alternatywny („Kings and Queens”)
- 2011 MTV Video Music Awards:Najlepszy teledysk rockowy („Closer to the Edge”)
- 2013 MTV Video Music Awards:Najlepszy teledysk alternatywny („Up in the Air”)
- Nagrody Billboard Music Awards 2014:Najlepsza piosenka rockowa („Up in the Air”)
- 2015 iHeartRadio Music Awards:Najlepsza piosenka roku w gatunku alternatywnego rocka („Walk on Water”)
- Nagrody Alternative Press Music Awards 2017:Najlepszy zespół grający na żywo
- Nagrody Lo Nuestro 2018:Piosenka roku pop/rock („Rescue Me”)
Oprócz tych nagród, 30 Seconds to Mars było także nominowane do wielu innych nagród, w tym do nagród Grammy i Brit Awards.