- Medal Newbery'ego w dziedzinie beletrystyki w 2005 roku za Kroniki Spiderwick
- Nagroda Eisnera dla najlepszego pisarza/artysty w 2006 roku za Najzimniejszą dziewczynę w Coldtown
- Nagroda Edgara dla Najlepszego Młodego Dorosłego w 2011 roku dla Białego Kota
- Nagroda Nebula dla najlepszej noweli w 2012 roku za „Dziewczynę, która wypiła księżyc”
- World Fantasy Award dla najlepszej powieści 2019 dla Okrutnego Księcia