Z drugiej strony, zdaniem krytyków, tajemnica Zakonu Różokrzyżowców, nacisk na symbolikę i hierarchiczny charakter ich organizacji mogą być przez niektórych postrzegane jako charakterystyczne dla kultu. Niektórzy byli członkowie Zakonów Różokrzyżowców również wyrazili zarzuty manipulacji i wyzysku finansowego, chociaż twierdzenia te nie dotyczą wyłącznie Zakonu Różokrzyżowców i nie są reprezentatywne dla wszystkich grup różokrzyżowców.
Ostatecznie to, czy Zakon Różokrzyżowców jest sektą, jest kwestią opinii i może zależeć od osobistych doświadczeń, przekonań i perspektyw danej osoby.